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クラウドでのLuminex ImageStream解析

Read Time 1 mins | Written by: Kenneth Hough

LuminexのImageStream®サイトメーターは、生物学や医学の分野の科学者が私たちの細胞内に隠された謎を理解するために使用する強力なツールです。このサイトメーターは、フローサイトメトリーと蛍光イメージングという二つの強力な分析方法を組み合わせています。フローサイトメトリーは、レーザー、光学、流体システムを使用して、タンパク質やDNAなどの多くの細胞特性を定量化する技術です。1960年代に発明されたフローサイトメーターは、生物学や医学研究における不可欠な機器です。一方、蛍光イメージングは、細胞の画像を撮影し、その構造と形態を理解するために使用される顕微鏡技術です。この技術は、蛍光「タグ」またはラベルを使用して細胞成分やタンパク質をマークし、それらがどこに位置しているか(局在)、他のどの分子と関連しているか(共局在)、細胞内外でどのように動くか(トラフィッキング)を理解します。

フローサイトメトリーと蛍光イメージングを組み合わせることで、定量的および質的データの両方にアクセスすることで、微小レベルで細胞を洞察することが可能になります。科学者は細胞のタンパク質発現だけでなく、その局在と細胞全体を通じたトラフィッキングについても学ぶことができます。

私たちは、特化した分析ソフトウェアが特定のプラットフォームやオペレーティングシステムを必要とすることが多いことを理解しています。例えば、ImageStream®の分析ソフトウェアであるIdeas®の場合のように。さらに、過度に忙しいコア施設のためにワークステーションへのアクセスが限られるなどのリソース制約が科学研究の進展を妨げることがあります。これらの問題に対処するために、私たちはアラバマ州に拠点を置くバイオテクノロジー企業のCytogence, Inc.と提携し、Amazon Web ServicesのAppStreem 2.0プラットフォームを使用して、クラウドでImageStream®データを分析する仮想ワークステーションを開発しました。私たちは、研究者がインターネットに接続されたどのデバイスからでも、タブレットを含む、安全かつ信頼性に優れた形でImageStreamデータを分析できる仮想ワークステーションを成功裏に展示しました。

スタートアップ向けアプリ開発を加速するためのフレームワーク

Kenneth Hough

背景

私は2020年3月にKeyQを創設しました。これは、革新的で意味のあるクラウドソリューションを提供することで、ビジネスが次の成功のレベルを達成するのを支援するというビジョンを持っています。その設立以来、私はいくつかの企業、非営利団体、大学と共に、ビジネスプロセスを合理化しコストを削減するのに役立つクラウドアプリケーションの設計と構築に取り組んできました。

KeyQに入る前は、アラバマ大学バーミンガム校(UAB)の肺、アレルギーおよび集中治療医学部で医学研究者でした。また、UABではJessy Deshane, PhDとVictor Thannickal, MDの指導の下、私の博士論文に取り組みました。UABでの博士研究中、私は「オミクス」およびビッグデータに触れ、クラウドでのデータ駆動型分析プラットフォームを開発するというキャリア選択に影響を与えました。

また、生化学を専攻したWorcester Polytechnic Institute(WPI)での学部教育にも大きな感謝を述べたいと思います。WPIのモットーは「Lehr und Kunst」で、大まかに「理論と実践」または「学習と熟練した芸術」に翻訳されます。WPIはこの教育法を真に大切にし、教育スタイルとクラスサイズによってそれが見て取れます。WPIでの学習経験はユニークであり、学び、実践し、応用することができる私を形作るのに大きく貢献しました。

個人的な興味

革新的な技術を学び、新しいことに挑戦することが大好きです。興味の範囲は広く、サーバーレスアーキテクチャ、機械学習、人工知能、バイオインフォマティクス、医療情報学、金融技術などが含まれます。また、2021年のCFAレベル1試験に向けて取り組んでいます。その他の興味や趣味には旅行、ロッククライミング、ラペリング、洞窟探検、キャンプ、園芸などがあります!